RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444498.5

NME4-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3

Gene NME4, Length 1,111 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-205ENST00000444498 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.52■■□□□ 1.04
NME4-205ENST00000444498 HIPK3Q9H422 1215 aa21.52■■□□□ 1.04
NME4-205ENST00000444498 BARHL2Q9NY43 387 aa21.52■■□□□ 1.04
NME4-205ENST00000444498 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.52■■□□□ 1.04
NME4-205ENST00000444498 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 STXBP3O00186 592 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 FIBPO43427 364 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 GPR153Q6NV75 609 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 TMEM199Q8N511 208 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 KAT2BQ92831 832 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SPATA33Q96N06 139 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PPFIA4O75335 1185 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SEMA3FQ13275 785 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.032e-8■■□□□ 13.7
NME4-205ENST00000444498 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.5■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SCG2P13521 617 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CYP2C18P33260 490 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 ADCY7P51828 1080 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 NEDD9Q14511 834 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 NLRX1Q86UT6 975 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SESTD1Q86VW0 696 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.49■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SMCO2A6NFE2 343 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SORBS3O60504 671 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 F2P00734 622 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CSF2RAP15509 400 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 NTRK3Q16288 839 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 METTL7BQ6UX53 244 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 GPRASP2Q96D09 838 aa21.48■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 HAS3O00219 553 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 ZNF286BP0CG31 522 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CYP2C9P11712 490 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 ITGB5P18084 799 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CHMP4BP1P59074 171 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 ANAPC15P60006 121 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PKN1Q16512 942 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CDHR1Q96JP9 859 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.47■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 SZT2Q5T011 3432 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 IFNAR1P17181 557 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PSEN2P49810 448 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 MFSD10Q14728 455 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 PHKBQ93100 1093 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NME4-205ENST00000444498 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 ESYT2A0FGR8 921 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 AP3B2Q13367 1082 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 TMEM240Q5SV17 173 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.021e-7■■■□□ 17.5
NME4-205ENST00000444498 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 IL23AQ9NPF7 189 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 JADE2Q9NQC1 790 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 MAFGO15525 162 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 CCL23P55773 120 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 MTMR1Q13613 665 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 PTGISQ16647 500 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 C7orf31Q8N865 590 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 GPR20Q99678 358 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 ALG1Q9BT22 464 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 ANO3Q9BYT9 981 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-205ENST00000444498 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.44■■□□□ 1.02
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