RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DDI1Q8WTU0 396 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 VPS50Q96JG6 964 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EPC1Q9H2F5 836 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MARCH7Q9H992 704 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EHD2Q9NZN4 543 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SPTLC1O15269 473 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ITGAXP20702 1163 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 VHLP40337 213 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NAA35Q5VZE5 725 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 USP26Q9BXU7 913 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NPTXRO95502 500 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 APOA1P02647 267 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CDH3P22223 829 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SOX5P35711 763 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MTX1Q13505 466 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LRP8Q14114 963 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PTGISQ16647 500 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KRT80Q6KB66 452 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PASD1Q8IV76 773 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ERP27Q96DN0 273 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ACAP3Q96P50 834 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SENP2Q9HC62 589 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT3Q9UH03 358 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ACSL4O60488 711 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF202O95125 648 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SCG2P13521 617 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB6P35237 376 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SCTRP47872 440 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MCL1Q07820 350 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NFE2L1Q14494 772 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GEN1Q17RS7 908 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SMU1Q2TAY7 513 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 WLSQ5T9L3 541 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 VPS53Q5VIR6 699 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CNGA4Q8IV77 575 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PJA1Q8NG27 643 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 COG1Q8WTW3 980 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CNKSR1Q969H4 720 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TTC34A8MYJ7 566 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LGR5O75473 907 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FAM107AO95990 144 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NPPAP01160 153 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NPR1P16066 1061 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 STX2P32856 288 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RFX8Q6ZV50 586 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CNBD1Q8NA66 436 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NCLNQ969V3 563 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NRBF2Q96F24 287 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FNBP1Q96RU3 617 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IPPQ9Y573 584 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 H3BQF6 201 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KRT16P08779 473 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ATP1A4Q13733 1029 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K14Q99558 947 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RAB17Q9H0T7 212 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 COG4Q9H9E3 785 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms