RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 KCNB2Q92953 911 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 IL23AQ9NPF7 189 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 KPNA6O60684 536 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 FGD1P98174 961 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 FUT2Q10981 343 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 LAMC2Q13753 1193 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 DGKDQ16760 1214 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PPTC7Q8NI37 304 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 BRF1Q92994 677 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 VWCEQ96DN2 955 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PGBD1Q96JS3 809 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SPATA33Q96N06 139 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GUCD1Q96NT3 240 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SIP14410 1827 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PIK3CDO00329 1044 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PPFIA3O75145 1194 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PSEN2P49810 448 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SP4Q02446 784 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 MFSD10Q14728 455 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 NOD1Q9Y239 953 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 REC8O95072 547 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 F2P00734 622 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PBX2P40425 430 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 NAPAP54920 295 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PTGISQ16647 500 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GNPTABQ3T906 1256 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 EYSQ5T1H1 3165 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 RPS6KB1P23443 525 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ICAM3P32942 547 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 HIC1Q14526 733 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 RASIP1Q5U651 963 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 STXBP3O00186 592 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 HAS3O00219 553 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 FIBPO43427 364 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 FGBP02675 491 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 LGALS2P05162 132 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 DNAJB2P25686 324 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TRIM50Q86XT4 487 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 C7orf31Q8N865 590 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 HERVK_113Q902F9 699 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 WNT8BQ93098 351 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TMEM260Q9NX78 707 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ZBBXA8MT70 800 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ADAMTS3O15072 1205 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ATP9AO75110 1047 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 STAM2O75886 525 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 IQCF3P0C7M6 154 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TGFB3P10600 412 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ITGB5P18084 799 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 METTL7BQ6UX53 244 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SESTD1Q86VW0 696 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 GPR20Q99678 358 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms