RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SP2Q02086 613 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SEMA3FQ13275 785 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 GTF3C6Q969F1 213 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 KPNA6O60684 536 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 DTNBO60941 627 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CTDNEP1O95476 244 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MMP3P08254 477 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CDK7P50613 346 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 NLRP5P59047 1200 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PSMC6P62333 389 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 ITGA7Q13683 1181 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 STK36Q9NRP7 1315 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 ITGB5P18084 799 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 BICD2Q8TD16 824 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 GPRASP2Q96D09 838 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SPATA33Q96N06 139 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 AIFM3Q96NN9 605 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 GRIN2DO15399 1336 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SREBF1P36956 1147 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 NEDD9Q14511 834 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MCTP2Q6DN12 878 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PPTC7Q8NI37 304 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 TOX2Q96NM4 488 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 JADE2Q9NQC1 790 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CLTBP09497 229 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MTMR1Q13613 665 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 RABEP1Q15276 862 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 DGKDQ16760 1214 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CDHR1Q96JP9 859 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP4P98171 946 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 FAAP100Q0VG06 881 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-205ENST00000426683 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 ATP9AO75110 1047 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 ZNF76P36508 570 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 CHMP4BP1P59074 171 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 ST3GAL1Q11201 340 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 METTL7BQ6UX53 244 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 WASF1Q92558 559 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 MAFGO15525 162 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 PPFIA4O75335 1185 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 KCNA2P16389 499 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 XBP1P17861 261 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 CEP55Q53EZ4 464 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 BLIDQ8IZY5 108 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 KIAA0355O15063 1070 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 JAK2O60674 1132 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 CYP3A4P08684 503 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 ZNF286BP0CG31 522 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms