RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 MTTPP55157 894 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 HDAC4P56524 1084 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC138Q96M89 665 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 LCA5LO95447 670 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ATICP31939 592 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 SKOR1P84550 965 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 DDI1Q8WTU0 396 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 THAP11Q96EK4 314 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CLTCL1P53675 1640 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ZMYM6O95789 1325 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ATF2P15336 505 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 GSTT1P30711 240 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 KIF11P52732 1056 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PSMD6Q15008 389 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ITSN1Q15811 1721 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ADCY8P40145 1251 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 STAT2P52630 851 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 JPH4Q96JJ6 628 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 O00370 1275 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 AGTP01019 485 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PLTPP55058 493 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 DMPKQ09013 629 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 COQ7Q99807 217 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PTPRGP23470 1445 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC22O60826 627 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 BCRP11274 1271 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 THAP9Q9H5L6 903 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 MED14O60244 1454 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RSPH10BP0C881 870 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PDE4BQ07343 736 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 KRT81Q14533 505 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 SNX12Q9UMY4 172 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 KRT8P05787 483 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 S100A1P23297 94 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 KRT40Q6A162 431 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC89Q8N998 374 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CFAP36Q96G28 342 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 EHD2Q9NZN4 543 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CHN1P15882 459 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 GNAQP50148 359 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CUEDC2Q9H467 287 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CBFA2T3O75081 653 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 TNFAIP3P21580 790 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 PTH1RQ03431 593 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 METTL24Q5JXM2 366 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 MAP4K1Q92918 833 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 A0A087WWV3 80 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC166P0CW27 439 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF76P36508 570 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ATG16L1Q676U5 607 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.98□□□□□ -1.29
SBNO1-202ENST00000420886 ZIM3Q96PE6 472 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms