RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MEIS2O14770 477 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPFIA4O75335 1185 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAJB2P25686 324 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSEN2P49810 448 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SP2Q02086 613 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BFSP2Q13515 415 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTGISQ16647 500 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.39■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBTB43O43298 467 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SORBS3O60504 671 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 F2P00734 622 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PFKMP08237 780 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ICAM3P32942 547 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFC2P35250 354 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MFSD10Q14728 455 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C7orf31Q8N865 590 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ALG1Q9BT22 464 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.38■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HAS3O00219 553 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FIBPO43427 364 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IQCF3P0C7M6 154 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF286BP0CG31 522 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FGD1P98174 961 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NEDD9Q14511 834 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RTN1Q16799 776 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNB2Q92953 911 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TIFAQ96CG3 184 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.37■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 REC8O95072 547 aa15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NLRX1Q86UT6 975 aa15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAGE1Q8TC20 777 aa15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.36■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACTN1P12814 892 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSPA4P34932 840 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PBX2P40425 430 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RCAN1P53805 252 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB30Q15771 203 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 METTL7BQ6UX53 244 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VWCEQ96DN2 955 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PBX4Q9BYU1 374 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF576Q9H609 170 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MSRAQ9UJ68 235 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.35■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBBXA8MT70 800 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 H3BRB1 525 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FUT2Q10981 343 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SEMA3FQ13275 785 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBE2SQ16763 222 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYLIPQ8WY64 445 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDHR1Q96JP9 859 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP26Q9BXU7 913 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms