RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM58Q8NG06 486 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX12Q9UMY4 172 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH10P35580 1976 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEMA6NI47 508 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 TACC1O75410 805 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 COA7Q96BR5 231 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA5Q96PV4 448 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC37A4O43826 429 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1B10O60218 316 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 BAG6P46379 1132 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 RRAGAQ7L523 313 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 CREG2Q8IUH2 290 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 SH2D4AQ9H788 454 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 USP40Q9NVE5 1235 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 TDP2O95551 362 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 GGCXP38435 758 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC13DQ70J99 1090 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC53A6NM62 1247 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO1CO00159 1063 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM66O15016 1216 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 IVLP07476 585 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCR5P32302 372 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC41Q15345 812 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 IQCEQ6IPM2 695 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR9Q96QG7 549 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 MAN2A1Q16706 1144 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SRLQ86TD4 932 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC31Q6UY01 552 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GAKO14976 1311 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC4Q7Z404 712 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 EHD2Q9NZN4 543 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 STK17AQ9UEE5 414 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIP5K2O43314 1243 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 DPEP1P16444 411 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK18Q7Z418 384 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 IQCDQ96DY2 449 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD17O75943 681 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX12PQ92771 950 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 NCK2O43639 380 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD21O60216 631 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KA5O75582 802 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA1P43355 309 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A5Q01650 507 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 YDJCA8MPS7 323 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 AGPSO00116 658 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 EDIL3O43854 480 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.92e-14■■■□□ 17.3
SH3BP1-202ENST00000417536 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD54LQ92698 747 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 PDHBP11177 359 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CRKP46108 304 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY7P51828 1080 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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