RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 CDHR1Q96JP9 859 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.6■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 LARGE1O95461 756 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 NLRP5P59047 1200 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM60Q495X7 471 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 NECAB1Q8N987 351 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 GPRASP2Q96D09 838 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM260Q9NX78 707 aa20.59■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 MYL3P08590 195 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 XBP1P17861 261 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 SREBF1P36956 1147 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 AFG1LQ8WV93 481 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 WASF1Q92558 559 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 PGBD1Q96JS3 809 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.58■□□□□ 0.89
SEMA3B-201ENST00000416295 ST18O60284 1047 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CTDNEP1O95476 244 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 GGPS1O95749 300 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MMP3P08254 477 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 NEDD9Q14511 834 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 GALNT17Q6IS24 598 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PPTC7Q8NI37 304 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.57■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ARVCFO00192 962 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MAFGO15525 162 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGB5P18084 799 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 BMP8BP34820 402 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGAP4P98171 946 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SP2Q02086 613 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MTMR1Q13613 665 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 DGKDQ16760 1214 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA33Q96N06 139 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 TOX2Q96NM4 488 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 BACH2Q9BYV9 841 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 JADE2Q9NQC1 790 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.56■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CDK7P50613 346 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 TLE2Q04725 743 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SEMA3FQ13275 785 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ITGA7Q13683 1181 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 AIFM3Q96NN9 605 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 GDF15Q99988 308 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.55■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF76P36508 570 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CEP55Q53EZ4 464 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 METTL7BQ6UX53 244 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 BLIDQ8IZY5 108 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.54■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ADAMTS3O15072 1205 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PPFIA4O75335 1185 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CYP3A4P08684 503 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CLTBP09497 229 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SYN1P17600 705 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PSMC6P62333 389 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 ALG1Q9BT22 464 aa20.53■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SORBS3O60504 671 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA3B-201ENST00000416295 GRIN2DO15399 1336 aa20.52■□□□□ 0.87
SEMA3B-201ENST00000416295 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms