RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 STAT3P40763 770 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 NOP2P46087 812 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 RAP1GDS1P52306 607 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 TNNC1P63316 161 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 SNCBQ16143 134 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC14Q49A88 953 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 XKR9Q5GH70 373 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DPH6Q7L8W6 267 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 NEK8Q86SG6 692 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 GPC2Q8N158 579 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 IWS1Q96ST2 819 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 TSC22D3Q99576 134 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PALMDQ9NP74 551 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DIABLOQ9NR28 239 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 H0YCG3 227 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ALDH1A1P00352 501 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R2P41236 205 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 INPP1P49441 399 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2A2P52657 109 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PTH1RQ03431 593 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ISM2Q6H9L7 571 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBPL3Q9H4L5 887 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 SCOCQ9UIL1 159 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 GNAT1P11488 350 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 LMNB2Q03252 620 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 COG2Q14746 738 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR44Q5JSH3 913 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP157Q5JU67 520 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ODR4Q5SWX8 454 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.643e-9■■□□□ 13
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF3C6Q969F1 213 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 EPSTI1Q96J88 318 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF146Q9NTX7 359 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1B0GW55 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 F5H6K3 240 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 N4BP3O15049 544 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 EVI5O60447 810 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF40O75150 1001 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 KLRC3Q07444 240 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 TFDP1Q14186 410 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PDIA6Q15084 440 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 STXBP2Q15833 593 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 Q3C1V9 767 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 MYCT1Q8N699 235 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC7A3Q8WY07 619 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP4K1Q92918 833 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 MMP19Q99542 508 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 DUX4Q9UBX2 424 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ZMYM6O95789 1325 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 ASB14A6NK59 587 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.645e-8■■■□□ 19.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms