RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
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C4orf48-201ENST00000409248 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.75■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.75■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.75■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.75■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.75■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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C4orf48-201ENST00000409248 BICD2Q8TD16 824 aa23.74■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.74■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 AIFM3Q96NN9 605 aa23.74■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.74■■□□□ 1.39
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C4orf48-201ENST00000409248 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.72■■□□□ 1.39
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C4orf48-201ENST00000409248 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.71■■□□□ 1.39
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C4orf48-201ENST00000409248 CEP290O15078 2479 aa23.71■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.71■■□□□ 1.39
C4orf48-201ENST00000409248 GGPS1O95749 300 aa23.7■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 PPTC7Q8NI37 304 aa23.7■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 AFG1LQ8WV93 481 aa23.7■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 C8orf76Q96K31 380 aa23.7■■□□□ 1.38
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C4orf48-201ENST00000409248 TLE2Q04725 743 aa23.68■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 ITGA7Q13683 1181 aa23.68■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 DGKDQ16760 1214 aa23.68■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 GALNT17Q6IS24 598 aa23.68■■□□□ 1.38
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C4orf48-201ENST00000409248 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.68■■□□□ 1.38
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C4orf48-201ENST00000409248 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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C4orf48-201ENST00000409248 SYN1P17600 705 aa23.67■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 MTMR1Q13613 665 aa23.67■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.67■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 SPATA33Q96N06 139 aa23.67■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.67■■□□□ 1.38
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C4orf48-201ENST00000409248 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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C4orf48-201ENST00000409248 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.66■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 JADE2Q9NQC1 790 aa23.66■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.66■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.66■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.66■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.65■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
C4orf48-201ENST00000409248 MAFGO15525 162 aa23.65■■□□□ 1.38
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