RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
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ANKRD54-203ENST00000407117 USP26Q9BXU7 913 aa31.9■■■□□ 2.7
ANKRD54-203ENST00000407117 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa31.9■■■□□ 2.7
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ANKRD54-203ENST00000407117 hCG_1984214I3L0E3 225 aa31.87■■■□□ 2.69
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ANKRD54-203ENST00000407117 CKBP12277 381 aa31.87■■■□□ 2.69
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA4P34932 840 aa31.87■■■□□ 2.69
ANKRD54-203ENST00000407117 FUT2Q10981 343 aa31.87■■■□□ 2.69
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
ANKRD54-203ENST00000407117 BCAS3Q9H6U6 928 aa31.87■■■□□ 2.69
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ANKRD54-203ENST00000407117 REC8O95072 547 aa31.86■■■□□ 2.69
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