RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 EMSYQ7Z589 1322 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 UPP2O95045 317 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH10BP0C881 870 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO11Q86XK2 927 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 TOP1MTQ969P6 601 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 YME1L1Q96TA2 773 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf42Q9H799 3197 aa22.61■■□□□ 1.21
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HOXD12-201ENST00000404162 LAMC2Q13753 1193 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 RPAINQ86UA6 219 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 PPTC7Q8NI37 304 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 IWS1Q96ST2 819 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 RMDN3Q96TC7 470 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 ALX1Q15699 326 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 CLUL1Q15846 466 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 SERINC5Q86VE9 423 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 TTC14Q96N46 770 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 SORBS3O60504 671 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 FGAP02671 866 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS33Q8NF86 280 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD12-201ENST00000404162 TRIOO75962 3097 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 ABCB11O95342 1321 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 MBTPS2O43462 519 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 MAF1Q9H063 256 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 NR3C2P08235 984 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 HYAL1Q12794 435 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 RNF135Q8IUD6 432 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT8Q92599 483 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 MYO7AQ13402 2215 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 COL4A6Q14031 1691 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 PPFIA4O75335 1185 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 HAND2P61296 217 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 IER5LQ5T953 404 aa22.55■■□□□ 1.2
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HOXD12-201ENST00000404162 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 PXMP2Q9NR77 195 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 NCK2O43639 380 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 RGS20O76081 388 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 MIER1Q8N108 512 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA33Q96N06 139 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 TECTAO75443 2155 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 GRM6O15303 877 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 TREHO43280 583 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 CTSHP09668 335 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 CTNNB1P35222 781 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 EDAQ92838 391 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 GGPS1O95749 300 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 CFBP00751 764 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00271P0C7V0 271 aa22.52■■□□□ 1.2
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HOXD12-201ENST00000404162 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
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HOXD12-201ENST00000404162 FIBCD1Q8N539 461 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 USP34Q70CQ2 3546 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 STXBP3O00186 592 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01565O15544 149 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 TBX10O75333 385 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 SP2Q02086 613 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 IL17RAQ96F46 866 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 FAM227BQ96M60 508 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD12-201ENST00000404162 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.51■■□□□ 1.19
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