RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 DEF6Q9H4E7 631 aa22.05■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 EPHB6O15197 1021 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 MOCS3O95396 460 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 TTLL1O95922 423 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 PPARDQ03181 441 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 MAP9Q49MG5 647 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 UIMC1Q96RL1 719 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.04■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 C6orf229H3BNL8 230 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 NCK2O43639 380 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 TXKP42681 527 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 PSMD2Q13200 908 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 GRB10Q13322 594 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 DONSONQ9NYP3 566 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 SPA17Q15506 151 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 DYMQ7RTS9 669 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 SATB1Q01826 763 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 LRRC63Q05C16 580 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 SEPT2Q15019 361 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 MIIPQ5JXC2 388 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 ZNF543Q08ER8 600 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 TMEM260Q9NX78 707 aa22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PAN3-201ENST00000380958 SLC26A4O43511 780 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GTF2IP78347 998 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 KRT79Q5XKE5 535 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.02■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 AGPSO00116 658 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 IRF6O14896 467 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 RAD54LQ92698 747 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PNMA5Q96PV4 448 aa22.01■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 AKR1B1P15121 316 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 TMEM119Q4V9L6 283 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ANO9A1A5B4 782 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 BUB1O43683 1085 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 AKR1B10O60218 316 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 CUL5Q93034 780 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MYMKA6NI61 221 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 RNF217Q8TC41 542 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 COA7Q96BR5 231 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 SLC37A4O43826 429 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PICALMQ13492 652 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 MAN2A1Q16706 1144 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 VWA3BQ502W6 1294 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 RRAGAQ7L523 313 aa21.99■■□□□ 1.11
PAN3-201ENST00000380958 PROM2Q8N271 834 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms