RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379848.5

SPG20-AS1-201, humanhuman

TSL 3

Gene SPG20-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG20-AS1-201ENST00000379848 STOX1Q6ZVD7 989 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MTMR8Q96EF0 704 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 OSBPL3Q9H4L5 887 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MTUS1Q9ULD2 1270 aa17.4■□□□□ 0.38
SPG20-AS1-201ENST00000379848 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SP2Q02086 613 aa17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SMC5Q8IY18 1101 aa17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 AMNQ9BXJ7 453 aa17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 CD320Q9NPF0 282 aa17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TANC1Q9C0D5 1861 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 LGR5O75473 907 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 FAM117BQ6P1L5 589 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 DSCC1Q9BVC3 393 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 C11orf16Q9NQ32 467 aa17.38■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 GPR37L1O60883 481 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TMEM31Q5JXX7 168 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SERINC5Q86VE9 423 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 DBF4BQ8NFT6 615 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SPATA33Q96N06 139 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 C16orf70Q9BSU1 422 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 KRT23Q9C075 422 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MAD2L2Q9UI95 211 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 INSL6Q9Y581 213 aa17.37■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 KLRF2D3W0D1 207 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PI4K2BG5E9Z4 385 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 ZBTB5O15062 677 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SORBS3O60504 671 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 GGPS1O95749 300 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 RSPH10BP0C881 870 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TGFB3P10600 412 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PGM5Q15124 567 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SEC23AQ15436 765 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SLC35G1Q2M3R5 365 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 CHD1LQ86WJ1 897 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SAMD3Q8N6K7 520 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 IL31RAQ8NI17 732 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 C17orf80Q9BSJ5 609 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.36■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HOXC8P31273 242 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 THPOP40225 353 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 NUCB1Q02818 461 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 LEXMQ3ZCV2 418 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 CNNM2Q9H8M5 875 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 EMSYQ7Z589 1322 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 PTPRSQ13332 1948 aa17.35■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HIP1O00291 1037 aa17.34■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 IGHDP01880 384 aa17.34■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 AMHP03971 560 aa17.34■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.34■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SPG20-AS1-201ENST00000379848 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 H3BRB1 525 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 AAMPQ13685 434 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 FAM178BQ8IXR5 827 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MYOCDQ8IZQ8 938 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 FBXO22Q8NEZ5 403 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TOP1MTQ969P6 601 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.33■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 TREHO43280 583 aa17.32■□□□□ 0.36
SPG20-AS1-201ENST00000379848 POLR2MP0CAP2 368 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms