RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 C7orf25Q9BPX7 421 aa17.23■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.23■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.23■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 GDAQ9Y2T3 454 aa17.23■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MYMKA6NI61 221 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 IKBKBO14920 756 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD10O75832 226 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF75DP51815 510 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 STX17P56962 302 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PGM5Q15124 567 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SPC24Q8NBT2 197 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SLC5A5Q92911 643 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM9Q9C026 710 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 FANCLQ9NW38 375 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ATP1A3P13637 1013 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PSMC6P62333 389 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 HYIQ5T013 277 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 LRCH2Q5VUJ6 765 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 LBX2Q6XYB7 198 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DYMQ7RTS9 669 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PXMP2Q9NR77 195 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PNMA2Q9UL42 364 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MYPNQ86TC9 1320 aa17.22■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CHMP2AO43633 222 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MYL5Q02045 173 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 HPS3Q969F9 1004 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEF1Q9HAY2 307 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 NMRK2Q9NPI5 230 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 RGL1Q9NZL6 768 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 STK17AQ9UEE5 414 aa17.21■□□□□ 0.35
CASQ1-201ENST00000368078 POTEFA5A3E0 1075 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CYP4A11Q02928 519 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 TKFCQ3LXA3 575 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 GPAT2Q6NUI2 795 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 POTEGQ6S5H5 508 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SAMD3Q8N6K7 520 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ACAD9Q9H845 621 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CYP39A1Q9NYL5 469 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PRCPP42785 496 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ASIC1P78348 528 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 AMPD3Q01432 767 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SARM1Q6SZW1 724 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DACH1Q9UI36 760 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.2■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 LCTP09848 1927 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 GAS7O60861 476 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CNMDO75829 334 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 MYL1P05976 194 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RPA1P27694 616 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 Q3C1V9 767 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NT5C3AQ9H0P0 336 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 JADE2Q9NQC1 790 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RMND1Q9NWS8 449 aa17.19■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ATP9AO75110 1047 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SLITRK3O94933 977 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RHOBTB3O94955 611 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G4BP0C869 781 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 FCER1AP12319 257 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 HERVK_113P62684 666 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PDE4DQ08499 809 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 STK4Q13043 487 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 KCNB1Q14721 858 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DDX12PQ92771 950 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NRBP1Q9UHY1 535 aa17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms