RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 DIAPH2O60879 1101 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 MBD4O95243 580 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 MTMR3Q13615 1198 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 BLMHQ13867 455 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
OPN3-201ENST00000366554 MDM1Q8TC05 714 aa23.9■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.89■■□□□ 1.42
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OPN3-201ENST00000366554 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.86■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 AFF2P51816 1311 aa23.86■■□□□ 1.41
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OPN3-201ENST00000366554 LRRC15Q8TF66 581 aa23.85■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.85■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 KCNJ2P63252 427 aa23.85■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.85■■□□□ 1.41
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OPN3-201ENST00000366554 F8VZ95 297 aa23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS3O15072 1205 aa23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 AHCYL1O43865 530 aa23.84■■□□□ 1.41
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OPN3-201ENST00000366554 ABL2P42684 1182 aa23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 TRAF1Q13077 416 aa23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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OPN3-201ENST00000366554 PRPHP41219 470 aa23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 RPS6KA3P51812 740 aa23.84■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.84■■□□□ 1.41
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OPN3-201ENST00000366554 PNMA2Q9UL42 364 aa23.83■■□□□ 1.41
OPN3-201ENST00000366554 MMEP08473 750 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 NCALDP61601 193 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 RARAP10276 462 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R2P41236 205 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 SNX1Q13596 522 aa23.82■■□□□ 1.4
OPN3-201ENST00000366554 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.82■■□□□ 1.4
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