RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CLSTN1O94985 981 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PKN1Q16512 942 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 IL17AQ16552 155 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 C3orf20Q8ND61 904 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 WHAMMQ8TF30 809 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PSMA7O14818 248 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MYZAPP0CAP1 466 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 SLC8A3P57103 927 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 GRIK3Q13003 919 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 TTI2Q6NXR4 508 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 HVCN1Q96D96 273 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 KRT12Q99456 494 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NOD2Q9HC29 1040 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NARFQ9UHQ1 456 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 BUB1O43683 1085 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V1G2O95670 118 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 GCKP35557 465 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MSL1Q68DK7 614 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MTMR8Q96EF0 704 aa18.51■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 AKR1B10O60218 316 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 STAT6P42226 847 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.5■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MCM7P33993 719 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 INHBEP58166 350 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 TROAPQ12815 778 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MYO1EQ12965 1108 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MTA3Q9BTC8 594 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 SCN7AQ01118 1682 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RPS6KA4O75676 772 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 FUT2Q10981 343 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CCT6BQ92526 530 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 HOOK2Q96ED9 719 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NYXQ9GZU5 481 aa18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PQJ5 194 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 C5orf60A6NFR6 353 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MAGEA1P43355 309 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CUL5Q93034 780 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PLCB1Q9NQ66 1216 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 EPHB6O15197 1021 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B3P37058 310 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 MIIPQ5JXC2 388 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RAPGEF5Q92565 580 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 TNFRSF25Q93038 417 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 TATDN2Q93075 761 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 SPDL1Q96EA4 605 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R7Q15435 360 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 ODF2Q5BJF6 829 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 FIGNQ5HY92 759 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 NOX5Q96PH1 765 aa18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 USP17L8P0C7I0 530 aa18.47■□□□□ 0.55
GDE1-201ENST00000353258 RCAN1P53805 252 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms