RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ELP3Q9H9T3 547 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RNF146Q9NTX7 359 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 POTEB3A0JP26 581 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 POTECB2RU33 542 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ATP2A1O14983 1001 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 PPATQ06203 517 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 PDE4DQ08499 809 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 POTEBQ6S5H4 581 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MOB2Q70IA6 237 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SLC5A5Q92911 643 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 EXOC1Q9NV70 894 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MYPNQ86TC9 1320 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 OTOFQ9HC10 1997 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RPA1P27694 616 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 UBASH3AP57075 661 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 NSMFQ6X4W1 530 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ERO1BQ86YB8 467 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ADSSL1Q8N142 457 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 WDR90Q96KV7 1748 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SCN4AP35499 1836 aa21.46■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 E9PMD0 336 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PSMD10O75832 226 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 ARP10275 920 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PAK1Q13153 545 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 TREML2Q5T2D2 321 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 IRF6O14896 467 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 CBFA2T2O43439 604 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 ITGB5P18084 799 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PTGS1P23219 599 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 DYMQ7RTS9 669 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 IL31RAQ8NI17 732 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 NELFBQ8WX92 580 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 DDX12PQ92771 950 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 OTUD5Q96G74 571 aa21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PPP2R5CQ13362 524 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 STIM1Q13586 685 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 UNC13DQ70J99 1090 aa21.44■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 POTEFA5A3E0 1075 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 EML1O00423 815 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 GAS7O60861 476 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PLA2G4BP0C869 781 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 POTEIP0CG38 1075 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 BCRP11274 1271 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 POTEGQ6S5H5 508 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 RMDN3Q96TC7 470 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 CXCL11O14625 94 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 COBLO75128 1261 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 STK4Q13043 487 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PTPRFP10586 1907 aa21.43■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 FCER1AP12319 257 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PLS1Q14651 629 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 PGM5Q15124 567 aa21.42■■□□□ 1.02
UPP1-201ENST00000331803 TKFCQ3LXA3 575 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms