RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CYP3A7P24462 503 aa18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 POSTNQ15063 836 aa18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 MCF2L2Q86YR7 1114 aa18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 ARP10275 920 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 Q3C1V9 767 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 STAT6P42226 847 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 HERVK_113P62684 666 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 ECM1Q16610 540 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 LBX2Q6XYB7 198 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 IQUBQ8NA54 791 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 DISC1Q9NRI5 854 aa18.29■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 PLCG1P19174 1290 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 TXLNAP40222 546 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 GPATCH11Q8N954 259 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 RMDN3Q96TC7 470 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 FDX1P10109 184 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 SNAPC2Q13487 334 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 MBOAT7Q96N66 472 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CYP3A4P08684 503 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 ITGB5P18084 799 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CIITAP33076 1130 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 PLCB2Q00722 1185 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 Q4G0T1 1027 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 MCTP2Q6DN12 878 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CHADLQ6NUI6 762 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 CBX8Q9HC52 389 aa18.27■□□□□ 0.52
CHTF18-202ENST00000317063 BMP6P22004 513 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 HUNKP57058 714 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CUL4BQ13620 913 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CEP55Q53EZ4 464 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.27■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CHMP2AO43633 222 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF165P49910 485 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CNTN2Q02246 1040 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CNMDO75829 334 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC172P0C7W6 258 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 OAZ1P54368 228 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 FSTL1Q12841 308 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 GRB10Q13322 594 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF16Q5VV41 709 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 KCNK18Q7Z418 384 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 PNMA5Q96PV4 448 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ACAD9Q9H845 621 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.26■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 PGM5Q15124 567 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 STX1AQ16623 288 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 CCL15Q16663 113 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 AK8Q96MA6 479 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 PDIA5Q14554 519 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 WDR78Q5VTH9 848 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD35Q8N283 1001 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 PXMP2Q9NR77 195 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 MAN1B1Q9UKM7 699 aa18.25■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 BTBD19C9JJ37 291 aa18.24■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 EML1O00423 815 aa18.24■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ATP2A1O14983 1001 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms