RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 NARFQ9UHQ1 456 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRG-201ENST00000295874 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRG-201ENST00000295874 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB17Q13105 803 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 BIRC3Q13489 604 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PIGSQ96S52 555 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CCSER1Q9C0I3 900 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PANK4Q9NVE7 773 aa13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 TTC26A0AVF1 554 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PSMD2Q13200 908 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SELENOSQ9BQE4 189 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 BARHL2Q9NY43 387 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 RPS6KA4O75676 772 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FLOT1O75955 427 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF18P17022 549 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GTF2IP78347 998 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ATP11AP98196 1134 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SEC23AQ15436 765 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 RAD9BQ6WBX8 426 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GPBP1Q86WP2 473 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GSDMBQ8TAX9 411 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ANO9A1A5B4 782 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CDK8P49336 464 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC63Q05C16 580 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 EPC1Q9H2F5 836 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ATP5DP30049 168 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GRAPQ13588 217 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SEPT2Q15019 361 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 RPS6KA1Q15418 735 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GEN1Q17RS7 908 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC38Q502W7 563 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC26Q8TAB7 109 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 NDST4Q9H3R1 872 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA1LP34931 641 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 TLDC2A0PJX2 215 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 STRN3Q13033 797 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 C12orf60Q5U649 245 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ADSSL1Q8N142 457 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 USP40Q9NVE5 1235 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SARSP49591 514 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GNPTABQ3T906 1256 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GLG1Q92896 1179 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ZEB2O60315 1214 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 TRPC3Q13507 836 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC125Q86Z20 511 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ABI1Q8IZP0 508 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CAPN11Q9UMQ6 739 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 WDR44Q5JSH3 913 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 UNC13DQ70J99 1090 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 GYPCP04921 128 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CYP27A1Q02318 531 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 RNF14Q9UBS8 474 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.8 ms