RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 NDST4Q9H3R1 872 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PFDN6O15212 129 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 APBA3O96018 575 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SCYL1Q96KG9 808 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PLCG1P19174 1290 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf54Q08AI8 447 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 MOCS3O95396 460 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 NME8Q8N427 588 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GCNT4Q9P109 453 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SGK1O00141 431 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CUL4BQ13620 913 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN21Q16825 1174 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC93Q567U6 631 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 BBOX1O75936 387 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PDE1BQ01064 536 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 MFAP3LO75121 409 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 FTCDO95954 541 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 DISC1Q9NRI5 854 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CDC25AP30304 524 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.268e-7■■■□□ 14.9
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1A3P13637 1013 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 RESP18Q5W5W9 173 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD1Q719H9 257 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 RFX6Q8HWS3 928 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.93■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ERBB3P21860 1342 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GSTA1P08263 222 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GSTA2P09210 222 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CASP8Q14790 479 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 KRT31Q15323 416 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 DGKHQ86XP1 1220 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP1Q9C000 1473 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 LRRN2O75325 713 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GFPT2O94808 682 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 BMP3P12645 472 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GCKP35557 465 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SATB1Q01826 763 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ASPHQ12797 758 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 NNTQ13423 1086 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 EMBQ6PCB8 327 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 MB21D1Q8N884 522 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 OPHN1O60890 802 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PARVGQ9HBI0 331 aa22.92■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G4BP0C869 781 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CXCR5P32302 372 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 NEK9Q8TD19 979 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CDHR1Q96JP9 859 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CLIC2O15247 247 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 AIFM3Q96NN9 605 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 H7C1W4 665 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PTPREP23469 700 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 HVCN1Q96D96 273 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 GPC4O75487 556 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 KRT3P12035 628 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms