RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 TSKSQ9UJT2 592 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GGA2Q9UJY4 613 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 BICDL2A1A5D9 508 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ORC4O43929 436 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GCP02774 474 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FCER1AP12319 257 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DTHD1Q6ZMT9 781 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SGMS1Q86VZ5 419 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF507Q8TCN5 953 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM33Q9UPN9 1127 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 STK36Q9NRP7 1315 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 AKAP12Q02952 1782 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PYGLP06737 847 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 NQO1P15559 274 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LIFRP42702 1097 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RPS6KA3P51812 740 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MTMR3Q13615 1198 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TEKT4Q8WW24 435 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RUBCNQ92622 972 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KLRC1P26715 233 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 LAMB3Q13751 1172 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DYMQ7RTS9 669 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SART1O43290 800 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SHBGP04278 402 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CHRNA2Q15822 529 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 IFT74Q96LB3 600 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 AZI2Q9H6S1 392 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PPIP5K2O43314 1243 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ITIH3Q06033 890 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CD302Q8IX05 232 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 P3H4Q92791 437 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 NDST4Q9H3R1 872 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 AGAP1Q9UPQ3 857 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TNKSO95271 1327 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TTI1O43156 1089 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PRLRP16471 622 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ATP4AP20648 1035 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 HOOK3Q86VS8 718 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 STAG2Q8N3U4 1231 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM51Q9BSJ1 452 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 NEUROG2Q9H2A3 272 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 WDR19Q8NEZ3 1342 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 MYH13Q9UKX3 1938 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP73A6NFT4 308 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 KRT13P13646 458 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 RAD23BP54727 409 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PLTPP55058 493 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ICA1Q05084 483 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC6Q16204 474 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 SFMBT2Q5VUG0 894 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GDAP1Q8TB36 358 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 PACSIN1Q9BY11 444 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 ZHX3Q9H4I2 956 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 GPR108Q9NPR9 543 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRR-201ENST00000283228 F8W031 263 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RAB27AP51159 221 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CABP4P57796 275 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL30Q0D2K2 578 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 STK4Q13043 487 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 USP4Q13107 963 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NUGGCQ68CJ6 796 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DENND2CQ68D51 928 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LRIG3Q6UXM1 1119 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ISCUQ9H1K1 167 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 EBF2Q9HAK2 575 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LRP2BPQ9P2M1 347 aa12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms