RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRE11P49959 708 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PGM5Q15124 567 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LETM2Q2VYF4 491 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNERQ8NFT8 737 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAML3Q96JK9 1138 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRRDQ9UH36 339 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM17Q9Y577 477 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NR3C2P08235 984 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP4P98171 946 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXC6P09630 235 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRPHP41219 470 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTOP1Q7RTM1 612 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRYGNQ8WXF5 182 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APBA2Q99767 749 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VWA3AA6NCI4 1184 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPECC1Q5M775 1068 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EEPD1Q7L9B9 569 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC5A4Q9NY91 659 aa23■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEMFO60524 1076 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXD10P28358 340 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SDF4Q9BRK5 362 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDP2O95551 362 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC192P0DO97 292 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EDNRBP24530 442 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARMCX2Q7L311 632 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR52Z1P0C646 297 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELNP15502 786 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP2C19P33261 490 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE4DQ08499 809 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17AQ16552 155 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UIMC1Q96RL1 719 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TINF2Q9BSI4 451 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCM3APO60318 1980 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HTTP42858 3142 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM86B1E9PN63 330 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNRH1P01148 92 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCND2P30279 289 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF6Q15052 776 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIB2Q92519 343 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IWS1Q96ST2 819 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBSNQ9H1K0 784 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASB14A6NK59 587 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP3A4P08684 503 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF76P36508 570 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP49Q70CQ1 688 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAET1EQ8TD07 263 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGS20O76081 388 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGB5P18084 799 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP11P51784 963 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TYRO3Q06418 890 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM32Q13049 653 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STXBP2Q15833 593 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MORC4Q8TE76 937 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPSTI1Q96J88 318 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CENPFP49454 3210 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADCY3O60266 1144 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POTEDQ86YR6 584 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC37A4O43826 429 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRF5Q13568 498 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LONRF3Q496Y0 759 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRR16Q569H4 304 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms