RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269724.5

SAMD1-201, Transcript of sterile alpha motif domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SAMD1, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1-201ENST00000269724 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.89■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 DPF3Q92784 378 aa21.89■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.89■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.89■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 TMEM260Q9NX78 707 aa21.89■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.89■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CYP3A4P08684 503 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ITGB5P18084 799 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 BEX3Q00994 111 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 NEDD9Q14511 834 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 BLIDQ8IZY5 108 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 COPS5Q92905 334 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 AIFM3Q96NN9 605 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ALG1Q9BT22 464 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 JADE2Q9NQC1 790 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.88■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 EVI5O60447 810 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 PTGS1P23219 599 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ARHGAP4P98171 946 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 SEMA3FQ13275 785 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 PPTC7Q8NI37 304 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 FERMT2Q96AC1 680 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.87■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 M0R2N6 131 aa21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 SP2Q02086 613 aa21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MTMR1Q13613 665 aa21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 NPY5RQ15761 445 aa21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CEP55Q53EZ4 464 aa21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 PGBD1Q96JS3 809 aa21.86■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ADAMTS3O15072 1205 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 JAK2O60674 1132 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 GGPS1O95749 300 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MMP3P08254 477 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 METTL7BQ6UX53 244 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 AFG1LQ8WV93 481 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.85■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 MEIS1O00470 390 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 PPFIA4O75335 1185 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CIITAP33076 1130 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 USP11P51784 963 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 DGKDQ16760 1214 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 TMX3Q96JJ7 454 aa21.84■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 KCNA2P16389 499 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ZNF76P36508 570 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 RTP1P59025 263 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 TRIM29Q14134 588 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 SPATA33Q96N06 139 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 TOX2Q96NM4 488 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.83■■□□□ 1.09
SAMD1-201ENST00000269724 CEP290O15078 2479 aa21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 ARVCFO00192 962 aa21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 CDK7P50613 346 aa21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.82■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 MYL3P08590 195 aa21.81■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.81■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 TRIM60Q495X7 471 aa21.81■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.81■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 NFASCO94856 1347 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 FAM86B1E9PN63 330 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 ATP9AO75110 1047 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 MMP1P03956 469 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 KRT2P35908 639 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 ITGA7Q13683 1181 aa21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SAMD1-201ENST00000269724 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms