RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 TRAPPC10P48553 1259 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PMS2P54278 862 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GRAMD1AQ96CP6 724 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TOM1L1O75674 476 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PPARAQ07869 468 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SH2D3CQ8N5H7 860 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ICA1LQ8NDH6 482 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 BACH1O14867 736 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NEK2P51955 445 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 LONP2Q86WA8 852 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ABCC12Q96J65 1359 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ITGA6P23229 1130 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 LSP1P33241 339 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SIRT2Q8IXJ6 389 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 UIMC1Q96RL1 719 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MED23Q9ULK4 1368 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RASA4BC9J798 803 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RASA4O43374 803 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 LRRC31Q6UY01 552 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GSTA1P08263 222 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GSTA2P09210 222 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 STX1BP61266 288 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 KRT81Q14533 505 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NEK8Q86SG6 692 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SGSM3Q96HU1 749 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 AFPP02771 609 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 IL1RL1Q01638 556 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NR1H3Q13133 447 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RESP18Q5W5W9 173 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GALNT17Q6IS24 598 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SPC25Q9HBM1 224 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 F8W031 263 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PPM1KQ8N3J5 372 aa17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NDST4Q9H3R1 872 aa17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SLC44A4Q53GD3 710 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 APOA5Q6Q788 366 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CRLF3Q8IUI8 442 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MLXIPLQ9NP71 852 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD2Q9GZV1 360 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NSFP46459 744 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC9Q8WXX5 260 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 VTI1AQ96AJ9 217 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MLXIPQ9HAP2 919 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 STAM2O75886 525 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NSMCE1Q8WV22 266 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TEKT4Q8WW24 435 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ZNF653Q96CK0 615 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NOD2Q9HC29 1040 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 STAT2P52630 851 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SLC20A2Q08357 652 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NECTIN1Q15223 517 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 GPR162Q16538 588 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NYAP1Q6ZVC0 841 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ATG3Q9NT62 314 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 A2MP01023 1474 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TNKSO95271 1327 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 GNGT2O14610 69 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms