RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 GPRASP2Q96D09 838 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 GJB2P29033 226 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 RGS19P49795 217 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 GUCY1B3Q02153 619 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP55Q53EZ4 464 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 TBCKQ8TEA7 893 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 TNFRSF25Q93038 417 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 SPC25Q9HBM1 224 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM86B1E9PN63 330 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 COL6A1P12109 1028 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT2P35908 639 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 BEX3Q00994 111 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGAP1Q07960 439 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRX1Q86UT6 975 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 JADE2Q9NQC1 790 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KBTBD13C9JR72 458 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 GH1P01241 217 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR1Q13613 665 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 GNASQ5JWF2 1037 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 ALPK3Q96L96 1907 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 BTBD18B2RXH4 712 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 MEIS1O00470 390 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.562e-9■□□□□ 10
SLC25A39-201ENST00000225308 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 IFFO2Q5TF58 517 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF3AQ9Y496 699 aa24.78■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 CIITAP33076 1130 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNA10Q16322 511 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 INF2Q27J81 1249 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 CDHR1Q96JP9 859 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 PHF24Q9UPV7 400 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM205CA6NFA0 338 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 A6NJR5 290 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP9AO75110 1047 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 GGPS1O95749 300 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF76P36508 570 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 USP11P51784 963 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 HSCBQ8IWL3 235 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 MAFGO15525 162 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ARP10275 920 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNA2P16389 499 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ACLYP53396 1101 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 SORBS3O60504 671 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ASGR1P07306 291 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 CPT1AP50416 773 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 AFG1LQ8WV93 481 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 LENG9Q96B70 501 aa24.75■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 LAMC2Q13753 1193 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 NEDD9Q14511 834 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 FERMT2Q96AC1 680 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PQY0 241 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PRR16Q569H4 304 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 METTL7BQ6UX53 244 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PPTC7Q8NI37 304 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 TDP2O95551 362 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 MMP3P08254 477 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP3A7P24462 503 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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