RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CCE1	Q03702	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SEG1	Q04279	960 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CIA1	Q05583	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MRX10	Q05648	414 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FMP45	Q07651	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	UBR1	P19812	1950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MET17	P06106	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CMK2	P22517	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PEX34	P25584	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SYN8	P31377	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MEI5	P32489	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	DOM34	P33309	386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
KAR2	YJL034W	UBA4	P38820	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ELP2	P42935	788 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	NUP85	P46673	744 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SNX4	P47057	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MNT2	P53059	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IRC15	Q02733	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RSC9	Q03124	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PPN1	Q04119	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PEX12	Q04370	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SYO1	Q07395	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RSB1	Q08417	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RAD59	Q12223	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	HER1	Q12276	1246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	AI3	P03877	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ARG81	P05085	880 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FUS1	P11710	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	KSS1	P14681	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MNN2	P38069	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	HSE1	P38753	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SSN3	P39073	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	VMA7	P39111	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RBG1	P39729	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MEP2	P41948	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	LSB6	P42951	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	FET5	P43561	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GAT1	P43574	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PTR3	P43606	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	EFM3	P47163	339 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ZRG17	P53735	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YNR068C	P53754	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	VAC7	P53950	1165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RSN1	Q03516	953 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	NSE5	Q03718	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PEX10	Q05568	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	ENT2	Q05785	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GPI11	Q06636	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	BAG7	Q12128	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	HSP42	Q12329	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RPN6	Q12377	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	CDC21	P06785	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PBS2	P08018	668 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RAP1	P11938	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	REV1	P12689	985 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	MET8	P15807	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PXA2	P34230	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SPC34	P36131	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	BMT2	P38278	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	APD1	P38281	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	DBP8	P38719	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	PCL5	P38794	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IES5	P40060	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	SER33	P40510	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GAB1	P41733	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	GLG2	P47011	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KAR2	YJL034W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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