RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637307.1

POLG-223, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, human

TSL 5

Gene POLG, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLG-223	ENST00000637307	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TBC1D5	Q92609	795 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	HLA-C	Q95604	372 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TTC14	Q96N46	770 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		11.69	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	KDM4A	O75164	1064 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GJB5	O95377	273 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	MMP3	P08254	477 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ERVK-21	P61565	698 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GHRHR	Q02643	423 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	BFSP2	Q13515	415 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	AAMP	Q13685	434 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	WNT8B	Q93098	351 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.68	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RAD50	Q92878	1312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307		B4E1Z4	1266 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SELP	P16109	830 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CALML3	P27482	149 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PDE4D	Q08499	809 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	HIC1	Q14526	733 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SEC23A	Q15436	765 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PTGIS	Q16647	500 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ESR2	Q92731	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.67	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CKB	P12277	381 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	HOXC8	P31273	242 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	USH1G	Q495M9	461 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RGS20	O76081	388 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	F2	P00734	622 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GH1	P01241	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RAD9A	Q99638	391 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
POLG-223	ENST00000637307	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.65	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms