RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620026.1

TULP4-207, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene TULP4, Length 680 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-207ENST00000620026 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 FPGSQ05932 587 aa24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 LRCH3Q96II8 777 aa24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.42■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 A6NJR5 290 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 TIMP1P01033 207 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 CPA1P15085 419 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 ITGB8P26012 769 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 PSMA5P28066 241 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 AFG1LQ8WV93 481 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.41■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 Q6ZUG5 572 aa24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 TBX21Q9UL17 535 aa24.4■■□□□ 1.5
TULP4-207ENST00000620026 LAMC2Q13753 1193 aa24.39■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 SHHQ15465 462 aa24.39■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 GNPTABQ3T906 1256 aa24.39■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 TMEM199Q8N511 208 aa24.39■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 IL31RAQ8NI17 732 aa24.39■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 GRIN2DO15399 1336 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 SORBS3O60504 671 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 ARHGAP1Q07960 439 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 MFSD5Q6N075 450 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 KCNB2Q92953 911 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 HIPK3Q9H422 1215 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 LTBP2Q14767 1821 aa24.38■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 B4GALT4O60513 344 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CD4P01730 458 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 MMP3P08254 477 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 APOBRQ0VD83 1088 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 DGKDQ16760 1214 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 BRF1Q92994 677 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 NOD1Q9Y239 953 aa24.37■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 RPS6KB1P23443 525 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 NAPAP54920 295 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.36■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 PIK3CDO00329 1044 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 STAM2O75886 525 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 GGPS1O95749 300 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 TGFB3P10600 412 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CYP2C18P33260 490 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 SPATA33Q96N06 139 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 LAMA3Q16787 3333 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.35■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 MEIS2O14770 477 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 RGS20O76081 388 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 RCAN1P53805 252 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 UBE2SQ16763 222 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 PPTC7Q8NI37 304 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.34■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CSF2RAP15509 400 aa24.33■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 EPHB4P54760 987 aa24.33■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.33■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 NLRX1Q86UT6 975 aa24.33■■□□□ 1.49
TULP4-207ENST00000620026 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 CCL23P55773 120 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.32■■□□□ 1.48
TULP4-207ENST00000620026 SZT2Q5T011 3432 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms