RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 IKBKEQ14164 716 aa21.29■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TOMM22Q9NS69 142 aa21.29■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 FGRP09769 529 aa21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 LY6KQ17RY6 165 aa21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.28■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF543Q08ER8 600 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 VPS53Q5VIR6 699 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 CHST3Q7LGC8 479 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 C7orf31Q8N865 590 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 RGS22Q8NE09 1264 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.27■■□□□ 1
UBE2C-208ENST00000617055 TRIOO75962 3097 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 PTK7Q13308 1070 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 DGKDQ16760 1214 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 USH1GQ495M9 461 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 INSL6Q9Y581 213 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 PSEN2P49810 448 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MRE11P49959 708 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MBTPS1Q14703 1052 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 ALG1Q9BT22 464 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 NEK9Q8TD19 979 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 WNT8BQ93098 351 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 C5orf42Q9H799 3197 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MYO7AQ13402 2215 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 DCXO43602 365 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 LGR5O75473 907 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 AMHP03971 560 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 SNHG28P0DPA3 235 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MFSD10Q14728 455 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 ALX1Q15699 326 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 PTPROQ16827 1216 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 F2P00734 622 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF286BP0CG31 522 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 NHLH1Q02575 133 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 STXBP2Q15833 593 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 TBC1D5Q92609 795 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 TTC14Q96N46 770 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 IWS1Q96ST2 819 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 COL20A1Q9P218 1284 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 EMSYQ7Z589 1322 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 HAS3O00219 553 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 EPC2Q52LR7 807 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 PPTC7Q8NI37 304 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 RMDN3Q96TC7 470 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MAF1Q9H063 256 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 MYH6P13533 1939 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2C-208ENST00000617055 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 POTEB3A0JP26 581 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 FGAP02671 866 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 MX1P20591 662 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 LAMC2Q13753 1193 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 POTEBQ6S5H4 581 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 MIER1Q8N108 512 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 BANK1Q8NDB2 785 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 FBXL18Q96ME1 805 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 SAMD11Q96NU1 681 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 KCNH6Q9H252 994 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2C-208ENST00000617055 CPVLQ9H3G5 476 aa21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms