RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 IWS1Q96ST2 819 aa28.44■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 CERS4Q9HA82 394 aa28.44■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.44■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 CFBP00751 764 aa28.43■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.43■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
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CDKN3-211ENST00000611205 IL27Q8NEV9 243 aa28.42■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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CDKN3-211ENST00000611205 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 CAGE1Q8TC20 777 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 KAT2BQ92831 832 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 DGKDQ16760 1214 aa28.4■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 AMNQ9BXJ7 453 aa28.4■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 PXMP2Q9NR77 195 aa28.4■■■□□ 2.14
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CDKN3-211ENST00000611205 HERC6Q8IVU3 1022 aa28.39■■■□□ 2.14
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CDKN3-211ENST00000611205 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 ALG1Q9BT22 464 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN3-211ENST00000611205 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
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CDKN3-211ENST00000611205 IL25Q9H293 177 aa28.38■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 KLRF2D3W0D1 207 aa28.37■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 PSEN2P49810 448 aa28.37■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 C7orf31Q8N865 590 aa28.37■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.37■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.37■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 MFSD10Q14728 455 aa28.35■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.35■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.34■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 HOMER1Q86YM7 354 aa28.34■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 PDCD2LQ9BRP1 358 aa28.34■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 CKBP12277 381 aa28.33■■■□□ 2.13
CDKN3-211ENST00000611205 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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CDKN3-211ENST00000611205 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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CDKN3-211ENST00000611205 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 F2P00734 622 aa28.31■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 RBL2Q08999 1139 aa28.31■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 PGM5Q15124 567 aa28.31■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 HAS3O00219 553 aa28.3■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 RGS20O76081 388 aa28.3■■■□□ 2.12
CDKN3-211ENST00000611205 GGPS1O95749 300 aa28.3■■■□□ 2.12
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