RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 CYP21A2P08686 494 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.44■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 NHLH1Q02575 133 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 TRDNQ13061 729 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 DGKHQ86XP1 1220 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 MAP4K1Q92918 833 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 CD320Q9NPF0 282 aa22.43■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 DCXO43602 365 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PDHBP11177 359 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 KCNA5P22460 613 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 SLC16A2P36021 539 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 SNAP25P60880 206 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 RAD9AQ99638 391 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 KAT14Q9H8E8 782 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 SIP14410 1827 aa22.41■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF15O94989 841 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ERVK-21P61565 698 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 NSMFQ6X4W1 530 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 PNMA1Q8ND90 353 aa22.4■■□□□ 1.18
SGMS1-208ENST00000608287 B4DLN1 442 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 E7EWF7 191 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF543Q08ER8 600 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PPP2R5BQ15173 497 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PTPROQ16827 1216 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 CASC1Q6TDU7 716 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ANKS1AQ92625 1134 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PNMA2Q9UL42 364 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 GJB5O95377 273 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SNHG28P0DPA3 235 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 TET1Q8NFU7 2136 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 FBXL18Q96ME1 805 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 A6NJR5 290 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 CDC45O75419 566 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PTGISQ16647 500 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 NCOA7Q8NI08 942 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SCFD2Q8WU76 684 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PTPRSQ13332 1948 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ICAM1P05362 532 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 IL9P15248 144 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SELPP16109 830 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PTGS1P23219 599 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 LCHNA4D1U4 455 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SEC23AQ15436 765 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SAMD11Q96NU1 681 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 LCTP09848 1927 aa22.35■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ERICH2A1L162 156 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 LINC01553A4QN01 128 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PDE4DQ08499 809 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 IKBKEQ14164 716 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 CHST3Q7LGC8 479 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms