RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 RMDN3Q96TC7 470 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PTPN18Q99952 460 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PNMA3Q9UL41 463 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MSH4O15457 936 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 UBA7P41226 1012 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 CEP55Q53EZ4 464 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PXMP2Q9NR77 195 aa22.25■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 FSD2A1L4K1 749 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 POTEMA6NI47 508 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TBX3O15119 743 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 FOXN1O15353 648 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PGM5Q15124 567 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 E2F4Q16254 413 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.24■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TXLNAP40222 546 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MAF1Q9H063 256 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MEIS1O00470 390 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ITGB5P18084 799 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ERCC3P19447 782 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 RGMBQ6NW40 437 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 FBXO40Q9UH90 709 aa22.23■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SLFN14P0C7P3 912 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 CABP7Q86V35 215 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 FAM20AQ96MK3 541 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 RAB34Q9BZG1 259 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TSPY26PQ9H489 355 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 DISC1Q9NRI5 854 aa22.22■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ARP10275 920 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PNOCQ13519 176 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 IQUBQ8NA54 791 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 PLIN2Q99541 437 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SLC25A27O95847 323 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ERVK-9P63128 1117 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ERVK-24P63145 666 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TYRO3Q06418 890 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.21■■□□□ 1.15
PGS1-211ENST00000589425 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 CCDC192P0DO97 292 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 LRRC15Q8TF66 581 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.2■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 A0A087WWV3 80 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 CNTN2Q02246 1040 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 KANK3Q6NY19 840 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 RBSNQ9H1K0 784 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 USP25Q9UHP3 1055 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 NR3C2P08235 984 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 PRR29P0C7W0 189 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 SLC5A5Q92911 643 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 PAGE5Q96GU1 130 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 PFASO15067 1338 aa22.19■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 TOMM70O94826 608 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 PLCG1P19174 1290 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 STAT6P42226 847 aa22.18■■□□□ 1.14
PGS1-211ENST00000589425 AFMP43652 599 aa22.18■■□□□ 1.14
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