RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 NFIBO00712 420 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 OPLAHO14841 1288 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 STX6O43752 255 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ALAS1P13196 640 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP5P59047 1200 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP46P62068 366 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HERVK_113P62684 666 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RESTQ13127 1097 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 COG2Q14746 738 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 XP32Q5T750 250 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM160B2Q86V87 743 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO11Q86XK2 927 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 UIMC1Q96RL1 719 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CPA4Q9UI42 421 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCO2A6NFE2 343 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RASSF10A6NK89 507 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BQV1 296 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED4O75132 1171 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2B1P20020 1258 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 UBXN2AP68543 259 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R5BQ15173 497 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 AMNQ9BXJ7 453 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PORCNQ9H237 461 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BARHL2Q9NY43 387 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 COL20A1Q9P218 1284 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MAN1A2O60476 641 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G6O60733 806 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BRD1O95696 1058 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D8O95759 1140 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 F13A1P00488 732 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CFBP00751 764 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP1P03956 469 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCA1P28370 1054 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CAP1Q01518 475 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM29Q14134 588 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR78Q5VTH9 848 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NSMFQ6X4W1 530 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 LBX2Q6XYB7 198 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 BLIDQ8IZY5 108 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 IL27Q8NEV9 243 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC102AQ96A19 550 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCC1Q9HA90 598 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF146Q9NTX7 359 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 UTRNP46939 3433 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 LCTP09848 1927 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 UNCXA6NJT0 531 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 EDIL3O43854 480 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ICAM1P05362 532 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC3P19447 782 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CALML3P27482 149 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms