RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP55Q53EZ4 464 aa29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD23Q86SG2 305 aa29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 SAPCD2Q86UD0 394 aa29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX58Q96C10 678 aa29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPY26PQ9H489 355 aa29.39■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.38■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 PXMP2Q9NR77 195 aa29.38■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.38■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEMA6NI47 508 aa29.37■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 MEIS1O00470 390 aa29.37■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 FAM20AQ96MK3 541 aa29.37■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 DISC1Q9NRI5 854 aa29.37■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 USP25Q9UHP3 1055 aa29.37■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.36■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.36■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXN1O15353 648 aa29.36■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 MARCH6O60337 910 aa29.36■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 CABP7Q86V35 215 aa29.36■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 IQUBQ8NA54 791 aa29.36■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC192P0DO97 292 aa29.35■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 Q3C1V9 767 aa29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PDXDC2PQ6P474 469 aa29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPN18Q99952 460 aa29.35■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.35■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 NAALADL2Q58DX5 795 aa29.34■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 SLC25A27O95847 323 aa29.34■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 SETQ01105 290 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.34■■■□□ 2.29
SCAMP4-210ENST00000588555 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.34■■■□□ 2.29
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SCAMP4-210ENST00000588555 PRR29P0C7W0 189 aa29.31■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 RRAGBQ5VZM2 374 aa29.31■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 VSIG10LQ86VR7 867 aa29.31■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.31■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMD10O75832 226 aa29.3■■■□□ 2.28
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