RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PTPA	Q15257	358 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	INF2	Q27J81	1249 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775		Q4G0T1	1027 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TRIB2	Q92519	343 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	HAS1	Q92839	578 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	MTMR9	Q96QG7	549 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	APBA2	Q99767	749 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PITPNM1	O00562	1244 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	MAFG	O15525	162 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ADCY6	O43306	1168 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	STAM2	O75886	525 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	RGS2	P41220	211 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	LBX1	P52954	281 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	NUCB2	P80303	420 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SP2	Q02086	613 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ASB14	A6NK59	587 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC37A4	O43826	429 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ATP9A	O75110	1047 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ARIH2	O95376	493 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CYBA	P13498	195 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	FOSB	P53539	338 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TRIM29	Q14134	588 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	IL17A	Q16552	155 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	NEK8	Q86SG6	692 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	FERMT3	Q86UX7	667 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TCHH	Q07283	1943 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775		H3BQV1	296 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TBX3	O15119	743 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CTAGE5	O15320	804 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	PSMD10	O75832	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TDP2	O95551	362 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	AR	P10275	920 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TGFB3	P10600	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	KCNA2	P16389	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CYP2B6	P20813	491 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	HOXD10	P28358	340 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	UBXN2A	P68543	259 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TRIM32	Q13049	653 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	NBR1	Q14596	966 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	KIF22	Q14807	665 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	STXBP2	Q15833	593 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	IFFO2	Q5TF58	517 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TMUB2-208	ENST00000587775	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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