RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 SLC9A7Q96T83 725 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 OPLAHO14841 1288 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 SEC23AQ15436 765 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 PTGISQ16647 500 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CHST3Q7LGC8 479 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 KAT2BQ92831 832 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 AMNQ9BXJ7 453 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 PXMP2Q9NR77 195 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CFBP00751 764 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CA3P07451 260 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 HSD17B4P51659 736 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 GHRHRQ02643 423 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CAGE1Q8TC20 777 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 KLRF2D3W0D1 207 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 NR3C2P08235 984 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 DGKDQ16760 1214 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 MTMR8Q96EF0 704 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 ASB2Q96Q27 587 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB5O15062 677 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 BAIAP3O94812 1187 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PPTC7Q8NI37 304 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 TNFRSF10AO00220 468 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 F2P00734 622 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF286BP0CG31 522 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PDE4AP27815 886 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 RBL2Q08999 1139 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 LAMC2Q13753 1193 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 TTC22Q5TAA0 569 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 SELPP16109 830 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PSEN2P49810 448 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 TRDNQ13061 729 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 C7orf31Q8N865 590 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 RGS20O76081 388 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 MFSD10Q14728 455 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 GRM4Q14833 912 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 GPNMBQ14956 572 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 HOMER1Q86YM7 354 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 ALG1Q9BT22 464 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 CERS4Q9HA82 394 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 EPOPA6NHQ4 379 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 KIF28PB7ZC32 967 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 HAS3O00219 553 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 RFXAPO00287 272 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGEF15O94989 841 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 CYP21A2P08686 494 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 CKBP12277 381 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 KCNJ6P48051 423 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 TAP1Q03518 808 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PGM5Q15124 567 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 IL31RAQ8NI17 732 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-216ENST00000586813 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms