RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585714.1

ABCA9-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 4

Gene ABCA9, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-208	ENST00000585714	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ABCA9-208	ENST00000585714	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ABCA9-208	ENST00000585714	ASXL2	Q76L83	1435 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ABCA9-208	ENST00000585714	CUX2	O14529	1486 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ABCA9-208	ENST00000585714	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SDS	P20132	328 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	BRAP	Q7Z569	592 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	GPR27	Q9NS67	375 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	AQP7	O14520	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PSPN	O60542	156 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	GALK1	P51570	392 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SGPP1	Q9BX95	441 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	GPR160	Q9UJ42	338 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	NOTO	A8MTQ0	251 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	EFEMP2	O95967	443 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	GPR85	P60893	370 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	CHRNE	Q04844	493 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SNX17	Q15036	470 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PTPRO	Q16827	1216 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	INF2	Q27J81	1249 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SCLY	Q96I15	445 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714		A0A087X0B3	334 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	LCP1	P13796	627 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	NAT1	P18440	290 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PDE6B	P35913	854 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	DUSP4	Q13115	394 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	LAPTM5	Q13571	262 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MBLAC2	Q68D91	279 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MSC	O60682	206 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	CRTAM	O95727	393 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	BMP7	P18075	431 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	KCNC2	Q96PR1	638 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	C7orf72	A4D263	438 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	NPHS1	O60500	1241 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	RASGRP1	O95267	797 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	ASL	P04424	464 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	APP	P05067	770 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	GUCY1A3	Q02108	690 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	SSPN	Q14714	243 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	RELT	Q969Z4	430 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	KCTD3	Q9Y597	815 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA9-208	ENST00000585714		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714		A0A1W2PQY0	241 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	MYO1B	O43795	1136 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	OPA1	O60313	960 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	PDE8A	O60658	829 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	IGFALS	P35858	605 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCA9-208	ENST00000585714	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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