RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-215ENST00000582821 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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GGA3-215ENST00000582821 A0A1W2PPC1 479 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.08■□□□□ 0.16
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GGA3-215ENST00000582821 STAM2O75886 525 aa16.08■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 TGFB3P10600 412 aa16.08■□□□□ 0.16
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GGA3-215ENST00000582821 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.08■□□□□ 0.16
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GGA3-215ENST00000582821 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.08■□□□□ 0.16
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GGA3-215ENST00000582821 NAPAP54920 295 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 PKN1Q16512 942 aa16.04■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 MYSM1Q5VVJ2 828 aa16.04■□□□□ 0.16
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GGA3-215ENST00000582821 SCG2P13521 617 aa16.03■□□□□ 0.16
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GGA3-215ENST00000582821 SP2Q02086 613 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 PPTC7Q8NI37 304 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 TBX21Q9UL17 535 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.03■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 LAMA3Q16787 3333 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 FIBPO43427 364 aa16.02■□□□□ 0.16
GGA3-215ENST00000582821 PPFIA4O75335 1185 aa16.02■□□□□ 0.16
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