RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUL4AQ13619 759 aa37.87■■■■□ 3.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ADCYAP1R1P41586 468 aa37.87■■■■□ 3.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM29Q14134 588 aa37.87■■■■□ 3.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQSEC1Q6DN90 963 aa37.87■■■■□ 3.65
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRX1Q86UT6 975 aa37.77■■■■□ 3.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKLE1Q8NAG6 615 aa37.77■■■■□ 3.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ICAM3P32942 547 aa37.76■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDHR1Q96JP9 859 aa37.74■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BTBD18B2RXH4 712 aa37.72■■■■□ 3.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa37.72■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AP5M1Q9H0R1 490 aa37.72■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
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