RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 CTAGE9A4FU28 777 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 IDEP14735 1019 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 ANO3Q9BYT9 981 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 CDC23Q9UJX2 597 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 PSMD2Q13200 908 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 HYIQ5T013 277 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA1Q92805 767 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 EPC1Q9H2F5 836 aa25.83■■□□□ 1.73
EHD4-202ENST00000569223 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 GDF11O95390 407 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TUBB2AQ13885 445 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 KRT222Q8N1A0 295 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.82■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CHRNA5P30532 468 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 USP11P51784 963 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ZBED6P86452 979 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 AOC3Q16853 763 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 RABGGTAQ92696 567 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 LRRC63Q05C16 580 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 FIGNQ5HY92 759 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 MBOAT7Q96N66 472 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.81■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PQJ5 194 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CYP3A7P24462 503 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 HERVK_113P62684 666 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 COASYQ13057 564 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ABCB11O95342 1321 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 F5H6K3 240 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 MEIS2O14770 477 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 KLRC3Q07444 240 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 VWA3BQ502W6 1294 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.8■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CHMP4BP1P59074 171 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 AP3B2Q13367 1082 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 LRRC41Q15345 812 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CEP112Q8N8E3 955 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CNKSR1Q969H4 720 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 GMCL1Q96IK5 515 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 UIMC1Q96RL1 719 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 NDUFB10O96000 172 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 SNAP25P60880 206 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 AMNQ9BXJ7 453 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 SLC26A4O43511 780 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ENTPD3O75355 529 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 MAN2A1Q16706 1144 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 IQCDQ96DY2 449 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 TSG101Q99816 390 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 NDST4Q9H3R1 872 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.78■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 E9PMD0 336 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 JAG1P78504 1218 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 PANK4Q9NVE7 773 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 KRT83P78385 493 aa25.76■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.76■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 FBXO11Q86XK2 927 aa25.76■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
EHD4-202ENST00000569223 POTEB3A0JP26 581 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 POTECB2RU33 542 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms