RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	NOBOX	O60393	691 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	PLP2	Q04941	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	SV2C	Q496J9	727 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1B0GTL3	188 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227		H7BY64	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	AGRP	O00253	132 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	SGSM2	O43147	1006 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	SUSD5	O60279	629 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ITGAV	P06756	1048 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	C8B	P07358	591 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	RTP5	Q14D33	572 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	INF2	Q27J81	1249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CEP68	Q76N32	757 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	KY	Q8NBH2	561 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227		K7ESM1	405 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	DDAH1	O94760	285 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	TCF3	P15923	654 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	THBS2	P35442	1172 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	LTBR	P36941	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	MAFK	O60675	156 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP7B1	O75881	506 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	BCL6	P41182	706 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ECI1	P42126	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	GFRA1	P56159	465 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	NKX3-2	P78367	333 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ARID5A	Q03989	594 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	LSAMP	Q13449	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CAPNS1	P04632	268 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ITGB3	P05106	788 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	FGR	P09769	529 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	FPR2	P25090	351 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CNR2	P34972	360 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ETFB	P38117	255 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNJ6	P48051	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ITGA1	P56199	1179 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	LGI4	Q8N135	537 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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