RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566677.1

C15orf41-209, Transcript of chromosome 15 open reading frame 41, humanhuman

TSL 2

Gene C15orf41, Length 5,843 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41-209ENST00000566677 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 IDEP14735 1019 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 AKR1B1P15121 316 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CLUL1Q15846 466 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CCDC14Q49A88 953 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 Q9H521 79 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 SLX4Q8IY92 1834 aa4.81□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TTC36A6NLP5 189 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 YDJCA8MPS7 323 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PFDN1O60925 122 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 MCM7P33993 719 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 MTMR3Q13615 1198 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TRIM14Q14142 442 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 SLFN13Q68D06 897 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 BLIDQ8IZY5 108 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 VPS52Q8N1B4 723 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 BICD1Q96G01 975 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 DACT1Q9NYF0 836 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 BICDL2A1A5D9 508 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 LRRD1A4D1F6 860 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CUTAO60888 179 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 LMNB1P20700 586 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 MUM1Q2TAK8 710 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PRR16Q569H4 304 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TTC38Q5R3I4 469 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 KCTD1Q719H9 257 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 IFT20Q8IY31 132 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 WHAMMQ8TF30 809 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 SMIM23A6NLE4 172 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 HIP1RO75146 1068 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PPP6R2O75170 966 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 HPDP32754 393 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PPP1R7Q15435 360 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GPR162Q16538 588 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 C8orf74Q6P047 294 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 FAM151AQ8WW52 585 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 IDI2Q9BXS1 227 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CSRNP2Q9H175 543 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 EFCC1Q9HA90 598 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 SMCO2A6NFE2 343 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 ZNF174Q15697 407 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 ANKS1AQ92625 1134 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 AIFM3Q96NN9 605 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 PIGSQ96S52 555 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 LZTFL1Q9NQ48 299 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 KIF28PB7ZC32 967 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 BRD2P25440 801 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 GUCY1A2P33402 732 aa4.8□□□□□ -1.64
C15orf41-209ENST00000566677 ZNF131P52739 623 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms