RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 PTPRTO14522 1441 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 IFT172Q9UG01 1749 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.21□□□□□ -1.41
CAPN3-211ENST00000562199 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 C9IYK1 514 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 H3BRB1 525 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 K7ENM7 598 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 M0R2N6 131 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 DKK1O94907 266 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SMC2O95347 1197 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TNNT1P13805 278 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CD9P21926 228 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RXRGP48443 463 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 MRE11P49959 708 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RAB27AP51159 221 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RWDD2BP57060 319 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 PDIA5Q14554 519 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TKFCQ3LXA3 575 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC80Q76M96 950 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 VPS37DQ86XT2 251 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SIX5Q8N196 739 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 BICD2Q8TD16 824 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF25Q93038 417 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SH3GL1Q99961 368 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KRT82Q9NSB4 513 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 POGKQ9P215 609 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ADGRB2O60241 1585 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ERVK-7P63135 1459 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ESYT3A0FGR9 886 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RASSF10A6NK89 507 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KCNQ2O43526 872 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KPNA6O60684 536 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TMCC2O75069 709 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 APBA3O96018 575 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 GZMAP12544 262 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KRT10P13645 584 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TYRP1P17643 537 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ATP2B4P23634 1241 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINB3P29508 390 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 HSPA1LP34931 641 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 MXI1P50539 228 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TYRO3Q06418 890 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 POSTNQ15063 836 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 GRIK4Q16099 956 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 DGKHQ86XP1 1220 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KRT222Q8N1A0 295 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 Q8N3U1 123 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TBATAQ96M53 351 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 DISC1Q9NRI5 854 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 SNTG2Q9NY99 539 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ADGRL1O94910 1474 aa6.2□□□□□ -1.42
CAPN3-211ENST00000562199 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.2□□□□□ -1.42
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