RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 FEM1BQ9UK73 627 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB5O15062 677 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 BCRP11274 1271 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 SCG2P13521 617 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 KIF5BP33176 963 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 MCM2P49736 904 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 SEMA3FQ13275 785 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 COG2Q14746 738 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 USH1GQ495M9 461 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 CPA4Q9UI42 421 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 ARID2Q68CP9 1835 aa9.59□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ICAM1P05362 532 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SYT1P21579 422 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SMARCA1P28370 1054 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 UBE2SQ16763 222 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 C17orf99Q6UX52 265 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 HOMEZQ8IX15 550 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 CPXCR1Q8N123 301 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PGBD1Q96JS3 809 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ALG2Q9H553 416 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM260Q9NX78 707 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 MTMR6Q9Y217 621 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 MYPNQ86TC9 1320 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 MEIS2O14770 477 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ATP2A1O14983 1001 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 TBC1D8O95759 1140 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FBXO45P0C2W1 286 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 NOGQ13253 232 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 NR5A1Q13285 461 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 KRT40Q6A162 431 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FAM160B2Q86V87 743 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 IL31RAQ8NI17 732 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ALG1Q9BT22 464 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 EFCC1Q9HA90 598 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 RNF186Q9NXI6 227 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 BARHL2Q9NY43 387 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 CPLX1O14810 134 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 DEXIO95424 95 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ALAS1P13196 640 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ERVK-9P63128 1117 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ERVK-24P63145 666 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PPP2R5BQ15173 497 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FBXO11Q86XK2 927 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF592Q92610 1267 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 BTBD18B2RXH4 712 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 TLR2O60603 784 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 TRPA1O75762 1119 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 MMP1P03956 469 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 ERCC3P19447 782 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 PTGS1P23219 599 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 GNAQP50148 359 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 GHRHRQ02643 423 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-211ENST00000561438 RESTQ13127 1097 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms