RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559898.5

HDDC3-205, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-205ENST00000559898 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.58■□□□□ 0.89
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HDDC3-205ENST00000559898 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 SP2Q02086 613 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.57■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 TMEM199Q8N511 208 aa20.57■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.55■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.54■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.54■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 DDAH1O94760 285 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 DNAJB2P25686 324 aa20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.53■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 CPA1P15085 419 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 SEMA3FQ13275 785 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 GRIN2CQ14957 1233 aa20.52■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.52■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 HERVK_113Q902F9 699 aa20.52■□□□□ 0.88
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HDDC3-205ENST00000559898 PTPRSQ13332 1948 aa20.52■□□□□ 0.88
HDDC3-205ENST00000559898 CCDC69A6NI79 296 aa20.51■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 FGBP02675 491 aa20.51■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 MAP3K14Q99558 947 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.51■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 KPNA6O60684 536 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 GGPS1O95749 300 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 MYOGP15173 224 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 LIFRP42702 1097 aa20.5■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 RABGGTBP53611 331 aa20.5■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.5■□□□□ 0.87
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HDDC3-205ENST00000559898 CCND2P30279 289 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 PSEN2P49810 448 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 UBE2SQ16763 222 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 TCTN1Q2MV58 587 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 MICU3Q86XE3 530 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 MTA3Q9BTC8 594 aa20.49■□□□□ 0.87
HDDC3-205ENST00000559898 HAS3O00219 553 aa20.48■□□□□ 0.87
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