RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 WASF1Q92558 559 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS4O75173 837 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PGK1P00558 417 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SMPD1P17405 629 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 XBP1P17861 261 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MCM2P49736 904 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ST3GAL1Q11201 340 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC41Q15345 812 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MCTP2Q6DN12 878 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ANO3Q9BYT9 981 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GJA9P57773 515 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP5P59047 1200 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 AIFM3Q96NN9 605 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 Q9Y3F1 56 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GNPTABQ3T906 1256 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GALNT17Q6IS24 598 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM260Q9NX78 707 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR81Q562E7 1941 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 JAK2O60674 1132 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS20O76081 388 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SREBF1P36956 1147 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 NKX3-2P78367 333 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.58■■□□□ 1.05
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RABGGTA-208ENST00000558954 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ALG1Q9BT22 464 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-208ENST00000558954 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ARIH2O95376 493 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TGFB3P10600 412 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 COL6A1P12109 1028 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 GNASQ5JWF2 1037 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MYADML2A6NDP7 307 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 FIBPO43427 364 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 DTNBO60941 627 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 GH1P01241 217 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRX1Q86UT6 975 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 BLIDQ8IZY5 108 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TMX3Q96JJ7 454 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 PHF24Q9UPV7 400 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CTAGE5O15320 804 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ZEB2O60315 1214 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 PTGS1P23219 599 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ICAM3P32942 547 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CPT1AP50416 773 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP4P98171 946 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 LY6KQ17RY6 165 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 GPRASP2Q96D09 838 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CDHR1Q96JP9 859 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-208ENST00000558954 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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