RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 LCE3BQ5TA77 95 aa6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRPF39-212ENST00000557477 CEP68Q76N32 757 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF39-212ENST00000557477 CHST14Q8NCH0 376 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 SCRIBQ14160 1630 aa6.43□□□□□ -1.38
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