RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554304.5

SLC38A6-218, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-218ENST00000554304 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 OPLAHO14841 1288 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 STAM2O75886 525 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 MYL3P08590 195 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 CPA1P15085 419 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 RAG1P15918 1043 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 APOBRQ0VD83 1088 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 PGM5Q15124 567 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 GNPTABQ3T906 1256 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 RUFY3Q7L099 469 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 GDF15Q99988 308 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 TGFB3P10600 412 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 ITGA7Q13683 1181 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 FBXL16Q8N461 479 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 PIK3CDO00329 1044 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 CTAGE5O15320 804 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 CDK7P50613 346 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 NAPAP54920 295 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 LAMC2Q13753 1193 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 LY6KQ17RY6 165 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 COPS5Q92905 334 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC38A6-218ENST00000554304 A6NJR5 290 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 DGKDQ16760 1214 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NLRX1Q86UT6 975 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TDHQ8IZJ6 230 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MEIS2O14770 477 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 KIAA0355O15063 1070 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ARIH2O95376 493 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FAAP100Q0VG06 881 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 AFG1LQ8WV93 481 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 BADQ92934 168 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PRO3102Q9H379 93 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CPLX1O14810 134 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PTGS1P23219 599 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CDC27P30260 824 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ADCY7P51828 1080 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CHMP4BP1P59074 171 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ANAPC15P60006 121 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 NEDD9Q14511 834 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CDHR1Q96JP9 859 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 KAT6AQ92794 2004 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 SMCO2A6NFE2 343 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FIBPO43427 364 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 GGPS1O95749 300 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 TIMP1P01033 207 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 MMP3P08254 477 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PSMC6P62333 389 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 FPGSQ05932 587 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 ARHGAP1Q07960 439 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC38A6-218ENST00000554304 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms