RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PRR33	A8MZF0	331 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF15	O94989	841 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	FGA	P02671	866 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CKB	P12277	381 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PTK7	Q13308	1070 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	LAMC2	Q13753	1193 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GPNMB	Q14956	572 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TTC22	Q5TAA0	569 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DGKH	Q86XP1	1220 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GJD3	Q8N144	294 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	AFG1L	Q8WV93	481 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	COPS5	Q92905	334 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	INSL6	Q9Y581	213 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	EMSY	Q7Z589	1322 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MYH4	Q9Y623	1939 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	LCHN	A4D1U4	455 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	LINC01553	A4QN01	128 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	NBN	O60934	754 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PPFIA4	O75335	1185 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ARIH2	O95376	493 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CHMP4BP1	P59074	171 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP1	Q07960	439 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PTPRO	Q16827	1216 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	LY6K	Q17RY6	165 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PPTC7	Q8NI37	304 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ESR2	Q92731	530 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KAT2B	Q92831	832 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	FAM227B	Q96M60	508 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SAMD11	Q96NU1	681 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KCNH6	Q9H252	994 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	FAM50B	Q9Y247	325 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MCM3AP	O60318	1980 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ABCB11	O95342	1321 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MYO9B	Q13459	2157 aa		8	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688		A0A0D9SFI3	127 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	HAS3	O00219	553 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	LGR5	O75473	907 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	AMH	P03971	560 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SDS	P20132	328 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PSEN2	P49810	448 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	DEFB103A	P81534	67 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MFSD10	Q14728	455 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	USH1G	Q495M9	461 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	VPS53	Q5VIR6	699 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	IQCA1	Q86XH1	822 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	RMDN3	Q96TC7	470 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	NCK2	O43639	380 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CAND2	O75155	1236 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	F2	P00734	622 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	NR3C2	P08235	984 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	RSPH10B	P0C881	870 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TGFB3	P10600	412 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KCNA5	P22460	613 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TRAF1	Q13077	416 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
CS-233	ENST00000552688	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.98	□□□□□ -1.13

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